Recherche de profiles
Si une base de données de définition de séquences a des schémas définis qui incluent un champ clé primaire, c’est-à-dire des collections de loci qui créent ensemble des profils, par exemple pour MLST, ceux-ci peuvent être parcourus en cliquant sur le lien “By specific criteria” dans la section “Search for allelic profiles”.
Laisser les champs du formulaire de requête vide (l’affichage de ceux-ci peut varier selon les options de modification définies par l’utilisateur). Choisissez le champ pour trier les résultats, le nombre de résultats par page à afficher, et cliquez sur “Search”.
Cliquer sur l’hyperlien d’un profil affichera toutes les informations sur le profil.
Recherche de définitions de profiles
Cliquez sur le lien “By specific criteria” dans la section “Search for allelic profiles”.
Entrez les critères de recherche que vous souhaitez rechercher. Vous pouvez ajouter des critères de recherche en cliquant sur le bouton “+” dans la section “Locus/scheme fields”. Ils peuvent être combinés avec “AND” ou “OR”.
Chaque champ peut être interrogé en utilisant standard operators.
Cliquer sur l’hyperlien d’un profil affichera toutes les informations sur le profil.
D’autres options de recherche sont disponibles en cliquant sur l’onglet “Modify form options”.
Par exemple, vous pouvez saisir une liste d’attributs à rechercher en cliquant sur le bouton “Show” à côté de “Attribute values list”.
Une boîte de liste apparaîtra dans la page. Cacher l’onglet modification du formulaire en cliquant de nouveau sur le “X” dans le coin ou sur l’onglet violet. Maintenant, vous pouvez choisir l’attribut à rechercher avec une liste de valeurs.
Les valeurs de liste seront combinées avec tous les autres attributs entrés dans le formulaire de requête permettant de construire des requêtes complexes.
Vous pouvez également ajouter des filtres au formulaire en cliquant de nouveau sur l’onglet “Modify form options” et en sélectionnant “Filters”.
Les filtres disponibles varient selon la base de données. Ils seront combinés avec d’autres critères de requête ou listes d’attributs.
