Rechercher des différences entre allèles

Similarité des séquences

Pour trouver les séquences les plus semblables à un allèle sélectionné dans une base de données de définition de séquence, élargissez l’élément de menu “Analysis” et cliquez sur “Sequence similarity” sur la page de contenu.

../_images/sequence_similarity.png

Entrez le locus et l’identifiant d’allèle de la séquence à étudier et le nombre de correspondances les plus proches que vous aimeriez voir, puis appuyez sur submit.

../_images/sequence_similarity2.png

Une liste des allèles les plus proches sera affichée, ainsi que le pourcentage d’identité et le nombre de gaps (insertions-délétions) entre les séquences.

../_images/sequence_similarity3.png

Cliquez sur le bouton “Compare” approprié pour afficher une liste de différences de nucléotides et/ou un alignement de séquence.

../_images/sequence_similarity4.png

Comparaison de séquences

Pour comparer directement deux séquences, élargir la section “Analysis” et cliquer sur “Sequence comparison” sur la page de contenu d’une base de données de définition de séquences.

../_images/sequence_comparison.png

Entrez le locus et deux identifiants d’allèles à comparer. Cliquez sur submit.

../_images/sequence_comparison2.png

Une liste des différences de nucléotides et/ou un alignement seront affichés.

../_images/sequence_comparison3.png

Voir aussi

Locus Explorer plugin.